Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR34

Gm20379, Predicted gene, 20379 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20379A0A087WR34 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm20379A0A087WR34 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20379A0A087WR34 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20379A0A087WR34 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20379A0A087WR34 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms