Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28510A0A087WP28 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28510A0A087WP28 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms