Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm3550W4VSN7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms