Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CcniQ9Z2V9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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