Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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