Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
D17h6s53eQ9Z1R4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms