Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Plod1Q9R0E2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms