Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nubp2Q9R061 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Nubp2Q9R061 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Nubp2Q9R061 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Nubp2Q9R061 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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