Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SrfQ9JM73 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms