Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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