Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms