Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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