Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms