Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Abcg8Q9DBM0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms