Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms