Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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