Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6H2

Hspb11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb11Q9D6H2 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hspb11Q9D6H2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspb11Q9D6H2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspb11Q9D6H2 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspb11Q9D6H2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms