Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms