Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms