Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Use1Q9CQ56 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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