Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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Chmp3Q9CQ10 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Chmp3Q9CQ10 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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Chmp3Q9CQ10 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chmp3Q9CQ10 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Chmp3Q9CQ10 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Chmp3Q9CQ10 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Chmp3Q9CQ10 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Chmp3Q9CQ10 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
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Chmp3Q9CQ10 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Chmp3Q9CQ10 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Chmp3Q9CQ10 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Chmp3Q9CQ10 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Chmp3Q9CQ10 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Chmp3Q9CQ10 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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