Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rrbp1Q99PL5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rrbp1Q99PL5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms