Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Rcbtb2Q99LJ7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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