Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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