Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms