Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms