Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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