Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Csmd1Q923L3 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
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