Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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