Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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