Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms