Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Ccdc28aQ8CEI3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccdc28aQ8CEI3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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