Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms