Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp20Q8C6M1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usp20Q8C6M1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Usp20Q8C6M1 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp20Q8C6M1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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