Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms