Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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FarsaQ8C0C7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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FarsaQ8C0C7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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FarsaQ8C0C7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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FarsaQ8C0C7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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