Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Sectm1b-207ENSMUST00000170381 1011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm27195-201ENSMUST00000184283 681 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Pla2g4c-ps-201ENSMUST00000204668 1364 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trim35Q8C006 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ube2d3-201ENSMUST00000106291 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trim35Q8C006 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trim35Q8C006 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ngf-204ENSMUST00000198644 1120 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 H2-M1-201ENSMUST00000041662 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Olfr120-201ENSMUST00000077498 993 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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