Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usp47Q8BY87 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp47Q8BY87 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usp47Q8BY87 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp47Q8BY87 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Usp47Q8BY87 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp47Q8BY87 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp47Q8BY87 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Usp47Q8BY87 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp47Q8BY87 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms