Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms