Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms