Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms