Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NanogQ80Z64 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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