Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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