Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms