Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ParpbpQ6IRT3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms