Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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Ccdc18Q640L5 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Ccdc18Q640L5 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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Ccdc18Q640L5 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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Ccdc18Q640L5 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Ccdc18Q640L5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Ccdc18Q640L5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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