Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim28Q62318 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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