Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms