Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mdc1Q5PSV9 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mdc1Q5PSV9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Mdc1Q5PSV9 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mdc1Q5PSV9 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mdc1Q5PSV9 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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