Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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